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Ecologia de populações

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Observações de presença e ausência - modelagem

Carvalho et al. (2019) realizaram a predição potencial e futura de Eremanthus erythropappus (candeia) por meio do algoritmo RF - random forest (BREIMAN, 2001; CUTLER et al. 2007).


O algoritmo RF está entre aqueles que obrigatoriamente precisam de dados de ausência. Sugestão de trabalho sobre o assunto para leitura: Giannini et al. (2012).


Os atores utilizaram a seguinte estratégia de obtenção dos registros de presença e ausência:

Presença:

- Planos de manejo das populações nativas;

- Bancos de dados on-line: speciesLink e Global Biodiversity Information Facility (GBIF);

- Inventários em fragmentos de floresta nativa (registros de presença da espécie).

Ausência:

- Inventários em fragmentos de floresta nativa (onde não havia registros de presença da espécie).


Muitas vezes os dados de ausência podem ser raros e difíceis de serem obtidos, principalmente em regiões com insuficiência de inventários florísticos.


Neste sentido, existem algumas propostas para a obtenção de dados de pseudo-ausência, quando se pretende usar algoritmos que exigem tais informações (ver Giannini et al., 2012).


Eremanthus erythropappus (candeia) no Parque Ecológico Quedas do Rio Bonito em Lavras/MG. Foto: Fábio Vieira.


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BREIMAN, L. Random forests. Machine learning, v. 45, n. 1, p. 5-32, 2001. Link.


CARVALHO, M. C. et al. Potential and future geographical distribution of Eremanthus erythropappus (DC.) MacLeish: a tree threatened by climate change. Floresta e Ambiente, v. 26, n. 3, 2019. Link.


CUTLER, D. R. et al. Random forests for classification in ecology. Ecology, v. 88, n. 11, p. 2783-2792, 2007. Link.


GIANNINI, T. C. et al. Desafios atuais da modelagem preditiva de distribuição de espécies. Rodriguésia, v. 63, n. 3, 2012. Link.

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Fábio Vieira
Fábio Vieira
09 abr 2020

Wisz et al. (2008) apresentaram na Tabela 1 do artigo deles uma lista de algoritmos e informações sobre quais deles necessitam apenas de dados de presença (ex.: BIOCLIM), dados presença e ausência (GLM, GAM, entre outros), e dados presença comparada com toda a região de estudo (MAXENT).


Referência e link para o artigo:


WISZ, M. S. et al. Effects of sample size on the performance of species distribution models. Diversity and Distributions, v. 14, n. 5, p. 763-773, 2008. Link.

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